孫吳縣隸屬于黑龍江省黑河市，位于黑龍江省北部、黑河市中部，地處小興安嶺北麓。北鄰黑河市愛輝區，南鄰五大連池市，西鄰嫩江縣，東鄰遜克縣，距黑河市區106公里，是黑河市重要的交通樞紐。邊境線長35公里，與俄羅斯阿穆爾州的康斯坦丁諾夫卡區隔黑龍江相望。全縣總面積4318.9平方公里，轄1個街道辦事處，2鎮9鄉（含1個民族鄉）、94個行政村，2個國營農牧場、7個國有林場。總人口10.42萬人（2013年），有滿族、達斡爾族、俄羅斯族、鄂倫春族等19個少數民族。